Керакский тоннель был построен в 1910 — 1911 гг. под два пути. В разные годы эксплуатации в тоннеле выполняли работы по его осушению и реконструкции с целью ликвидации верхней и боковой негабаритности. С целью уменьшения обводненности, справа и слева от тоннеля, пройдены дренажные штольни.
При реконструкции тоннеля предусматривается: строительство нового двухпутного тоннеля параллельно существующему тоннелю с сооружением эвакуационной сбойки между тоннелями, переобустройство существующего тоннеля в дренажное и эвакуационное сооружение.